Frank Ebert stand schon als Jugendlicher der DDR kritisch gegenüber. Mit 18 Jahren engagierte er sich in der Umwelt-Bibliothek (UB) und organisierte verschiedene Protestaktionen in der DDR. Als am 4. September 1990 Bürgerrechtler die Stasi-Zentrale in Ost-Berlin besetzten und gegen eine Überführung der Stasi-Akten ins Bundesarchiv protestierten, war auch Ebert dabei.