Bei den Olympischen Spielen 1972 in München war Werner Panknin als Leichtathletik-Schiedsrichter dabei. Er hatte freien Zugang zum Olympischen Dorf, in dem am frühen Morgen des 5. September acht palästinensische Terroristen das Quartier der israelischen Mannschaft überfielen und zwei Männer sofort erschossen. Das anschließende 18-stündige Geiseldrama endete mit einer missglückten Befreiungsaktion auf dem nahe gelegenen Flughafen Fürstenfeldbruck.